Recenti ricerche indicano che la flora batterica intestinale abbia un ruolo importante nella patogenesi dell'obesità. Sono stati esaminati 184,094 sequenze del gene 16S rRNA con lo scopo di confrontare la flora batterica in 9 individui 3 per ogni categoria (normopeso, obeso, e soggetti che hanno appena subito un intervento di by-pass gastrico). L'analisi filogenetica ha dimostrato che, sebbene i batteri presenti nell'intestino umano siano molto diversi tra loro, possono comunque essere raggruppati in 6 divisioni batteriche che hanno contraddistinto i 3 gruppi di studio. Nello specifico, sono stati i Firmicutes la popolazione dominante nei soggetti normopeso e in quelli moderatamente obesi ma sono diminuiti in maniera significativa nei soggetti che avevano subito il bypass gastrico (che avevano aumentato la popolazione di Gammaproteobacteria). Il numero di H2 prodotto dai Prevotellaceae è stato notevolmente maggiore nei soggetti obesi. Utilizzando una PCR in real-time, abbiamo rilevato un numero notevolmente maggiore di H2 utilizzando l'Archaea metano genica nel tratto gastrointestinale nei soggetti obesi rispetto ai soggetti normali e a quelli che avevano subito l'intervento di by-pass gastrico. La coesistenza di batteri che producono H2 con un numero relativamente elevato di Archaea mentano genici che utilizzano H2 nel tratto gastrointestinale dei soggetti obesi ha portato alla formulazione dell'ipotesi dell'esistenza di un transfer tra le interspecie di H2 e le specie archea e che questo processo rappresenti un meccanismo importante per l'aumento dell'assorbimento di energia nell'intestino dei soggetti obesi. La maggiore popolazione batterica rilevata nei soggetti post by-pass gastrico potrebbe riflettere il doppio impatto sull'intestino dovuto sia all'intervento chirurgico sia alle conseguenti modificazioni nell'ingestione e nella digestione dei cibi. Husen Zhanga, John K. DiBaiseb, Andrea Zuccoloc, Dave Kudrnac, Michele Braidottic, Yeisoo Yuc, Prathap Parameswarana, Michael D. Crowellb, Rod Wingc, Bruce E. Rittmanna1 and Rosa Krajmalnik-Browna Communicated by Charles J. Arntzen, Arizona State University, Tempe, AZ, December 13, 2008